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蛋白质组学研究与临床转化应用中，低丰度蛋白质的定量检测始终是技术瓶颈。这类蛋白虽然表达水平极低，却往往具有极高的生物学意义，例如炎症因子、细胞因子、转录因子或疾病早期标志物。DDA（Data Dependent Acquisition）模式受限于采集深度和动态范围，难以稳定检测这些低丰度靶标。（Pa
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血浆是蛋白质组学研究中最具临床转化价值的样本类型之一，因其来源广泛、获取便捷且包含丰富的系统性生物学信息。然而，血浆中蛋白质浓度动态范围可达10^10级别，高丰度蛋白（如白蛋白、免疫球蛋白）占据总蛋白质质量的90%以上，使得低丰度蛋白质——尤其是潜在的疾病标志物—
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PRM（Parallel Reaction Monitoring）作为靶向蛋白质组学的重要工具，具备高特异性、高灵敏度和优异的定量重现性，广泛应用于生物标志物验证、机制研究和临床样本定量分析。然而，高质量PRM数据的获取不仅依赖于质谱平台与实验流程的优化，更离不开标准化、严谨的数据处理策略。本文将系
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在多组学数据日益丰富的今天，表达组学（Transcriptomics） 依旧是揭示基因调控机制的主力手段之一。通过RNA-Seq等技术，研究者可以全面掌握基因在不同条件下的转录表达情况。然而，这种“表达即功能”的逻辑推演，正面临一个难以回避的盲区：转录水平的变化并不等于蛋白的
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在生物学研究中，我们常通过蛋白组学测定酶的表达水平来判断其功能状态。然而，酶的表达丰度≠活性状态。酶可能以失活形式存在，受到抑制剂调控，或通过翻译后修饰调节其功能。因此，“酶活性”才是反映其真实功能状态的关键指标。ABPP（Activity-Based Protein
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在药物发现与机制研究的早期阶段，传统的高通量筛选（HTS）方法虽然能从上万种小分子中识别活性化合物，却难以回答一个关键问题：“它是如何发挥作用的？”这正是活性位点标记的蛋白质组学技术——活性基团标记的蛋白质谱分析（Activity-Based Prot
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基于功能蛋白质组学的ABPP技术（Activity-Based Protein Profiling，活性基蛋白质谱分析），可用于在复杂的生物样本中检测、富集和鉴定具有催化活性的酶蛋白。本文将从ABPP技术的原理出发，系统解析其优势与局限，并探讨其在生命科学中的典型应用场景。 一、ABPP技术原理简
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Activity-Based Protein Profiling（ABPP）实验流程涉及从探针设计、样本处理，到信号检测和数据分析的多个关键步骤。以下是标准ABPP实验流程及每一步的操作要点，适用于大多数酶类研究（如丝氨酸酯酶、蛋白酶、脱酰化酶等）。 一、ABPP实验流程概览 1、活性探针准备 2
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一、什么是ABPP？ ABPP（Activity-Based Protein Profiling，活性基础蛋白质谱分析）是基于化学探针的蛋白质组学技术，专门用于检测酶类蛋白的“活性状态”，而非仅仅关注其表达水平。ABPP使用活性探针（Activity-Based Probes
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鸟枪法蛋白质组学（Shotgun Proteomics）是当前蛋白质组研究中应用最广泛的策略之一。它通过将复杂蛋白混合物酶解成肽段，并结合液相色谱-质谱联用技术（LC-MS/MS）实现大规模蛋白质鉴定与定量，广泛用于疾病机制解析、生物标志物筛选及功能蛋白研究。本文系统梳理鸟枪蛋白质组学从样本处理到数
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